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同じ名前のファイルにリダイレクト
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No1 の方が書いているとおり、Linuxに限らず、UNIX系OSで（少なくともcsh系では）リダイレクトによって出力をファイルに落とそうとすると、出力先のファイルがまず作られてからコマンドが実行されます。 このとき、既存のファイルと同じ名前のファイルを出力先に指定すると、強制的に空ファイルによって上書きされます。 （なんでそういう設計になっているかは知りません） ちなみにMS-DOS（試してないけどたぶんWin2k以上のコマンドプロンプトも）では、リダイレクトの際はまずテンポラリファイルに出力されてからリダイレクト先のファイルにコピーされるため、質問文のような記述をしても問題なく実行結果が出力されます。
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詳しい説明ありがとうございました。