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SEQファイルの開き方
塩基配列を機械で読み取り、その結果がseqファイルで出てきました。しかし、そのseqファイルをパソコンで開けません。 開き方を教えていただきたいです。
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シークエンス結果の解析ソフトは、フリーのものがいくつかあります。解析ソフトを使わず、seqファイルを直接開いてみても良いのですが、そういう解析ソフトを準備されると、後々、便利なことが多いです。波形も見れますし、もちろん、塩基配列もプリントアウト可能ですし。 「シークエンス波形解析について」をキーワードにして、gooなどの検索エンジンでひっかかてくるページを参照されると良いかと思います。 尚、seqファイルをエクセルなどで開けない時は、ブラウザの空白ページへ直接ドラッグアンドドロップすると、見れることがあります。
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ChromasLiteというフリーソフトがあります。 もしかするとseqファイルを開けるかもしれません。下記のURLを参照下さい。
- Dr_Hyper
- ベストアンサー率41% (2483/6032)
何の機械で(ABI XXX SEQUENCERなどの情報)配列を読み、FILE TYEPにはTEXTや波形ファイルがあるのかどうかの情報を教えてください。
- suiran2
- ベストアンサー率55% (1516/2748)
塩基配列云々は知りませんが,一般的に,seqファイルは1行のテキストファイルです。テキストファイルは,Windowsでしたら標準のノートパッド(Notepad)などのテキストエディタでみられると思いますが… Microsoft excelでもテキストファイルは見られると思いますし,それこそtxtで取り込めば多くのソフトで可能と思いますが…。だめなんでしょうか。全く自信ありませんが…
私はMacユーザーなので、この回答がWinユーザーにもあてはまるかどうか分かりませんが、自分も委託した塩基配列分析の結果をseqファイルで受け取ります。 このファイルはMac上では、テキストエディットまたはMicrosoft excelで開きます。