OKWAVEのAI「あい」が美容・健康の悩みに最適な回答をご提案!
-PR-
締切り
済み

FASTAやBLASTでのパラメータ設定:短い配列の時。

  • すぐに回答を!
  • 質問No.209273
  • 閲覧数440
  • ありがとう数3
  • 気になる数0
  • 回答数1
  • コメント数0

お礼率 50% (92/181)

FASTAやBLASTに、タンパクのN末を読んで得たせいぜい数十アミノ酸くらいの配列をsubmitする時は、(もっと長い配列をsubmitする時に比べて)パラメータ設定を色々工夫すべきなのでしょうか。
一つのORFくらいの長さ(数百から数千塩基か)なら、いつもデフォルトのままでsubmitしていますが特に問題は感じません。しかし、こういう短い配列の時はうまく設定しないと何も引っ掛からないのではと思っています。
御存じの方、宜しくお願い致します。
通報する
  • 回答数1
  • 気になる
    質問をブックマークします。
    マイページでまとめて確認できます。

回答 (全1件)

  • 回答No.1
レベル14

ベストアンサー率 50% (1133/2260)

 御存じの方ではありませんが,実際にやってみられてはいかがですか。その上で問題があれば,パラメ-タ設定について具体的に質問されるのが良いと思います。  なお,不要だとは思いますが,ネット上で相同性検索の出来るサイトを挙げておきます。 ...続きを読む
 御存じの方ではありませんが,実際にやってみられてはいかがですか。その上で問題があれば,パラメ-タ設定について具体的に質問されるのが良いと思います。

 なお,不要だとは思いますが,ネット上で相同性検索の出来るサイトを挙げておきます。


このQ&Aで解決しましたか?
関連するQ&A
-PR-
-PR-
このQ&Aにこう思った!同じようなことあった!感想や体験を書こう
このQ&Aにはまだコメントがありません。
あなたの思ったこと、知っていることをここにコメントしてみましょう。

その他の関連するQ&A、テーマをキーワードで探す

キーワードでQ&A、テーマを検索する
-PR-
-PR-
-PR-

特集


いま みんなが気になるQ&A

関連するQ&A

-PR-

ピックアップ

-PR-
ページ先頭へ